• 12.41 - 10.42 en la 5.U-Flottille, Kiel como Ausbildungsboot.
  
• 11.42 - 05.43 en la 1.U-Flottille, Brest como Frontboot.

• 20.12.41 - 17.02.43: OL Wolfgang Sporn
  
• 18.02.43 - 04.05.43: OL Helmut von Tippelskirch

1ª Patrulla
Zarpa de Kiel el 12 de Noviembre de 1942 hacia el Atlántico Norte.
El U439 junto a otros cinco uboote formarían parte del Grupo Panzer, el día 29 se encontraban a 800 millas al Oeste del Canal del Norte a la espera de un convoy ONS. Siguiendo a un posible contacto el Grupo Panzer pondría rumbo Oeste y el día 4 de Diciembre se detendrían al Noreste de St.John al no encontrar nada. Esa misma tarde el U524, del Grupo Draufgänger, intercepto varias emisiones radiofónicas que indicaban la presencia de un convoy al Noreste. El Grupo Panzer se dirigiría a toda máquina hacia el Noreste para interceptarlo.
El convoy HX217 sería avistado por el U524 el día 6 al mediodía, el convoy sería perseguido por los dos Grupos (Panzer y Draufgänger). La mala visibilidad provocaría que se perdiera el contacto hasta el día 7 cuando los uboot U135, U254, U439 y U465 lograron localizarlo. Los cuatro uboote serían alejados de la zona por un avión Liberator del escuadrón 120 (S/Ldr T.M.Bulloch).
El Grupo Panzer perseguiría al convoy HX217 pero la mala visibilidad evitaría los ataques. Varios uboote de los dos Grupos estuvieron en contacto con el convoy pero el aumento de la protección aérea, a partir del día 10, obligaría a suspender la operación el día 11. En total el convoy perdería a dos buques y la Kriegsmarine a dos uboote .

Tres uboote procedentes del Grupo Panzer, U439 – U135 y U211, formarían parte del Grupo Raufbold a partir del día 15 y se situarían al Oeste de Irlanda. Ese mismo día el U609 divisaría al convoy ON153 cruzando por el centro de la línea de patrulla. Esa misma noche sería hundido un mercante y otro resultaría dañado, ambos por el U610. El mal tiempo dificultaría los ataques y la operación finalizaría el día 21 al Suroeste de irlanda con el resultado de un mercante y de un destructor de escolta (HMS.Firebrake) hundidos. El U439 no llegaría a atacar al convoy ON153.

El U439 llegaría a su nueva base en Brest el 24 de Diciembre de 1942.

2ª Patrulla
Zarpa de Brest el 28 de Enero de 1943 y regresa el 2 de Febrero de 1943.

3ª Patrulla
Zarpa de Brest el 22 de Febrero de 1943 hacia el Atlántico Norte.
El U439 formaría parte del Grupo Neuland situado al Oeste de Irlanda. El día 7 de Marzo el U439, junto a diez uboote situados en el extremo Norte de la línea de patrulla, fueron enviados hacia el Noroeste como Grupo Ostmark. El día 8 formarían una línea de patrulla por delante del convoy SC121 que había sido avistado el día 6 al Sur de Groenlandia.

17 uboote de los Grupos Wildfang, Neptun y Burggraf operarían contra el convoy SC121 junto también al Grupo Ostmark. Serían hundidos doce buques del convoy y otro resultaría dañado antes de finalizar la operación el día 11 al Sur de Islandia. El U439 no tendría éxito.

A los uboote del Grupo Ostmark participantes en la operación contra el convoy SC121 se les unirían tres procedentes del Grupo Burggraf y otros de recién llegados para formar el Grupo Stürmer que a partir del día 14 de Marzo operaría en la zona central del Atlántico Norte contra el convoy SC122. El Grupo se dirigiría hacia el Oeste hasta el día 16 cuando giraría hacia el Suroeste para interceptar al convoy.

El contacto se produciría la noche del 16 al 17 de Marzo, los ataques durarían tres días, el U439 no realizaría ninguno. El día 17 el U439 sería atacado por un avión Liberator del escuadrón 86, el uboot quedaría dañado por las cargas de profundidad del avión. Dos días más tarde el U439 sería dañado de nuevo, esta vez por las cargas del Destructor HMS.Harvester.
El U439 llegaría a Brest el 28 de Marzo de 1943.

4ª Patrulla
Zarpa de Brest el 27 de Abril de 1943 para operar en el Atlántico.
El U439 formaría parte del Grupo Drossel que trazaría una línea de patrulla al Noroeste de Cabo Finisterre. El día 3 de Mayo el servicio de reconocimiento aéreo informaría de la presencia de un convoy formado por once mercantes y escoltado por seis Destructores al Noreste del Grupo. Los uboote se dirigirían hacia el Este para interceptarlo. Al contactar con el convoy se descubrió que estaba formado por quince LCT y dos escoltas.
El mal estado de la mar evitaría los ataques. A primera hora del día 4 el U439 y el U659 intentarían atacar al convoy. Mientras navegaban en la superficie ambos uboote chocarían seguramente por la distracción de los vigías que observaban como ardía en llamas uno de los escoltas a causa del ataque de un tercer uboot.
El U659 se hundiría de inmediato y el U439, con un gran agujero en la sección de proa estaba sentenciado. El otro escolta del convoy, siguiendo los restos de aceite, lograría rescatar a 12 supervivientes, tres procedentes del U659 y nueve del U439.
Morirían 40 tripulantes del U439, incluido su comandante.
La posición del hundimiento del U439 fue 43º32’N 13º20’W.